西南大学柑桔研究所（中国农业科学院柑桔研究所）位于重庆市北碚区国家级风景名胜区缙云山麓，风景秀丽的嘉陵江畔，成立于1960年，占地面积1918亩，是唯一的国家级柑桔专业科研机构。

历史沿革：成立于1960年，系农业部所属全国性柑桔科学研究专业机构。2001年9月起由中国农业科学院与西南农业大学共建。2005年7月由中国农业科学院与西南大学（由原西南师范大学与西南农业大学合并组建）共建该所，在保留原中国农业科学院柑桔研究所名称同时，成立西南大学柑桔研究所。

科研平台：农业部柑桔及苗木质量监督检验测试中心，国家柑桔工程技术研究中心，国家柑桔品种改良中心，国家柑桔苗木脱毒中心，国家果树种质重庆柑桔圃，国家柑桔加工技术研发分中心，国家柑桔野外观测台站，柑桔教育部工程研究中心，柑桔学重庆市市级重点实验室，重庆市植物病害生物学重点实验室，重庆市柑桔危险性有害生物检测鉴定中心，重庆市柑桔工程技术研究中心，农业部柑桔病虫害防控功能研究室，农业部柑桔栽培与耕作功能研究室，中国农业科学院柑桔学重点开放实验室。

农业部柑桔及苗木质量监督检验测试中心于1991年由农业部（1991）农（质）字第60号文批准组建。中心1995年7月首次通过国家计量认证和农业部机构审查认可，批准对外开展柑桔苗木、柑桔鲜果及加工产品质量监督检验测试工作。2003年4月经农业部批准成为无公害农产品定点检验机构。2008年12月经农业部批准成为农产品质量安全检测机构。2008年12月由农业部农产品质量安全中心批准成为全国农产品地理标志产品品质鉴定检测机构。2001年6月、2006年11月和2010年1月先后3次通过国家计量认证（资质认定）和农业部机构审查认可及农产品机构考核复查评审。中心主要开展柑桔全程质量安全控制技术研发；柑桔质量安全检测技术研究；柑桔质量安全标准制订；柑桔溯源检测技术研究；新型分离介质研发及其在农药检测中的应用。中心拥有柑桔农产品质量安全检测用仪器设备100多台套，总值2000万元，其中价值10万元以精密仪器设备31台套，30万元以上仪器设备有19台（套），拥有气相色谱仪（HPLC）、液相色谱仪（GC）、气-质联用仪、液相色谱-质谱-质谱联用仪、气相色谱-质谱-质谱联用仪、等离子发射光谱-质谱仪、离子色谱仪、氨基酸分析仪、毛细管电泳仪、全自动微生物检定仪、原子吸收光谱仪、原子荧光仪、近红外分析光谱仪等19台套检验测试仪器设备；拥有超临界CO2萃取仪、高速大容量冷冻离心机、旋转蒸发浓缩仪、超声波清洗器、均质器、全自动固相萃取仪、水浴氮吹仪、切割式研磨机、臼式研磨机、大容量摇瓶机等30多台套样品制备和前处理仪器设备。